Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc4O35988 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdc4O35988 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms