Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf18O35714 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf18O35714 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf18O35714 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms