Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-ObO35424 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-ObO35424 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms