Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd2O35392 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Foxd2O35392 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms