Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kpna6O35345 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kpna6O35345 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kpna6O35345 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna6O35345 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms