Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe40O35185 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe40O35185 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms