Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sema4dO09126 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema4dO09126 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4dO09126 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4dO09126 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms