Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Barx2O08686 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Barx2O08686 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Barx2O08686 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Barx2O08686 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Barx2O08686 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Barx2O08686 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Barx2O08686 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Barx2O08686 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Barx2O08686 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Barx2O08686 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Barx2O08686 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Barx2O08686 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Barx2O08686 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Barx2O08686 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Barx2O08686 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms