Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myh11O08638 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myh11O08638 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myh11O08638 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myh11O08638 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myh11O08638 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myh11O08638 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myh11O08638 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myh11O08638 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myh11O08638 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Myh11O08638 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myh11O08638 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myh11O08638 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myh11O08638 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myh11O08638 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myh11O08638 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms