Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms