Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efna5O08543 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efna5O08543 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efna5O08543 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efna5O08543 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Efna5O08543 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efna5O08543 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efna5O08543 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna5O08543 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Efna5O08543 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efna5O08543 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efna5O08543 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efna5O08543 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Efna5O08543 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Efna5O08543 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efna5O08543 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.9 ms