Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2888K7N746 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2888K7N746 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm2888K7N746 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms