Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2056J3QQ02 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2056J3QQ02 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms