Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC024978J3QPC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC024978J3QPC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BC024978J3QPC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC024978J3QPC3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC024978J3QPC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC024978J3QPC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BC024978J3QPC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC024978J3QPC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BC024978J3QPC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BC024978J3QPC3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC024978J3QPC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms