Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5814J3QP80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5814J3QP80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5814J3QP80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5814J3QP80 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5814J3QP80 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5814J3QP80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5814J3QP80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5814J3QP80 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms