Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3415J3QMS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3415J3QMS8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3415J3QMS8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333.7 ms