Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp870J3QMA4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp870J3QMA4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp870J3QMA4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp870J3QMA4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp870J3QMA4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Zfp870J3QMA4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Zfp870J3QMA4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Zfp870J3QMA4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Zfp870J3QMA4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp870J3QMA4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Zfp870J3QMA4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Zfp870J3QMA4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Zfp870J3QMA4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Zfp870J3QMA4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Zfp870J3QMA4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Zfp870J3QMA4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Zfp870J3QMA4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp870J3QMA4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp870J3QMA4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms