Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930544D05RikJ3QK56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930544D05RikJ3QK56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms