Protein–RNA interactions for Protein: H3BL40

Rgsl1, Regulator of G-protein-signaling-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgsl1H3BL40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rgsl1H3BL40 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rgsl1H3BL40 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rgsl1H3BL40 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rgsl1H3BL40 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rgsl1H3BL40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rgsl1H3BL40 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms