Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf4bG5E8Z2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf4bG5E8Z2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Taf4bG5E8Z2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 469.9 ms