Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N5

Nxph4, Neurexophilin, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxph4G3X9N5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxph4G3X9N5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nxph4G3X9N5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nxph4G3X9N5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nxph4G3X9N5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms