Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pnmal2G3X9N3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pnmal2G3X9N3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pnmal2G3X9N3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Pnmal2G3X9N3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pnmal2G3X9N3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Pnmal2G3X9N3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms