Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arfgef1G3X9K3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Arfgef1G3X9K3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Arfgef1G3X9K3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms