Protein–RNA interactions for Protein: G3X946

Gm4847, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4847G3X946 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4847G3X946 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm4847G3X946 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4847G3X946 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4847G3X946 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4847G3X946 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4847G3X946 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms