Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ttc37F8VPK0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ttc37F8VPK0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Ttc37F8VPK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ttc37F8VPK0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ttc37F8VPK0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ttc37F8VPK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Ttc37F8VPK0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ttc37F8VPK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Ttc37F8VPK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ttc37F8VPK0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ttc37F8VPK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms