Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmgcF6VRN1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SmgcF6VRN1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmgcF6VRN1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms