Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Raph1F2Z3U3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raph1F2Z3U3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Raph1F2Z3U3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms