Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh18E9Q9Q6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh18E9Q9Q6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms