Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc146E9Q9F7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc146E9Q9F7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc146E9Q9F7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms