Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc1E9Q5K9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ythdc1E9Q5K9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms