Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930579F01RikE9Q3L6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms