Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrp3E9Q1T6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp3E9Q1T6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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