Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx60E9PZQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx60E9PZQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx60E9PZQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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