Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pcdh10E9PXQ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcdh10E9PXQ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pcdh10E9PXQ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pcdh10E9PXQ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Pcdh10E9PXQ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pcdh10E9PXQ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms