Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttc17E9PVB5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc17E9PVB5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc17E9PVB5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms