Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca3bE9PUL3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clca3bE9PUL3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clca3bE9PUL3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3bE9PUL3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms