Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Piezo1E2JF22 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Piezo1E2JF22 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Piezo1E2JF22 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms