Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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