Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11bB4XVQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11bB4XVQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11bB4XVQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms