Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26c1B2RXA7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp26c1B2RXA7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26c1B2RXA7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp26c1B2RXA7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms