Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud7bB2RUR8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Otud7bB2RUR8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms