Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt4B2RU40 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt4B2RU40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt4B2RU40 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt4B2RU40 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt4B2RU40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt4B2RU40 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms