Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otud4B2RRE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud4B2RRE7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otud4B2RRE7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms