Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ythdc2B2RR83 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ythdc2B2RR83 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ythdc2B2RR83 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ythdc2B2RR83 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ythdc2B2RR83 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms