Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprsB0V2N1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprsB0V2N1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PtprsB0V2N1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PtprsB0V2N1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprsB0V2N1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms