Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem238A9JSM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms