Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samt1A2BED8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt1A2BED8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms