Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramef17A2ASJ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramef17A2ASJ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramef17A2ASJ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms