Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramel3A2AHA7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pramel3A2AHA7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramel3A2AHA7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms