Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisal2aA2A9G7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal2aA2A9G7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms