Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc27A2A6Q5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc27A2A6Q5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms